厦门大学既是教育中心，又是科学研究中心。学校积极贯彻教育为现代化建设服务的方针，取得了显著的科研成果。在自然科学和工程科学方面，1980年以来获得国家和省部级科研成果奖多项，其中国家自然科学奖8项，国家科技发明奖和科技进步奖7项。在人文社会科学方面，自1985年以来也取得了多硕成果奖。在重视基础理论研究的同时，强化了把科学技术转化为生产力的工作。一批应用科技成果获得了国家专利。这些成果为国家的改革开放和经济建设作出了积极的贡献。
厦门大学建有化学、生物学、应用经济学、理论经济学、海洋科学、工商管理、物理学七个博士后流动站，覆盖了17个博士点。
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