沙皇亚历山大二世像公元1881年3月1日，亚历山大二世乘着马车准备去签署法令，宣布改组国家委员会，启动俄罗斯君主立宪的政改进程。当他的马车经过格里博耶多夫运河河堤时，遭遇“民意党”极端分子的暗杀。刺客投掷的第一枚炸弹炸伤了亚历山大二世的卫兵和车夫，亚历山大二世不顾左右劝阻，执意下车查看卫兵伤势，结果刺客投掷的第二枚炸弹在他脚下爆炸，亚历山大二世双腿被炸断，被送回到冬宫几小时后因医治无效而死亡。公元1883年，亚历山大二世之子沙皇尼古拉二世为了纪念父皇，在其父遇刺地点修建这座教堂。公元1907年，教堂主体建造完成，以莫斯科红场上的圣瓦西里大教堂为蓝本，外观娇艳秀丽。公元1917年，俄国革命以后，教堂遭到洗劫和掠夺，其内部破坏严重。20世纪30年代，苏联政府关闭此教堂。公元1939年9月1日，爆发第二次世界大战，列宁格勒被德国军队围困期间，引发严重的饥荒，基督复活教堂被用作蔬菜仓库，因此得到了绰号“马铃薯上的救主”。公元1945年8月15日，第二次世界大战结束后，基督复活教堂被用作附近的一个歌剧院的仓库。公元1970年7月，教堂的管理改属圣以撒大教堂 （当时作为高利润的博物馆）。公元1997年8月，教堂在关闭27年后重新开放，但尚未祝圣，不作为全时间的礼拜场所。